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病毒變異及適應宿主受體分子重要位點研究
江蘇大學針對冠狀病毒源頭，致病機理和傳播機制等問題開展深入的基礎研究，為冠狀病毒長期防治提供科技支撐。 江蘇大學醫學院張文教授團隊迅速開展聯合攻關，利用江蘇大學醫學院檢驗醫學研究所建立的病毒宏基因組學分析平臺，聯合復旦大學醫學院及上海派森諾測序公司，對實驗室多年來保存的采集自100多種野生動物近10，000標本進行病毒宏基因組學分析，進行2019-nCoV溯源研究，以期確認新型冠狀病毒的自然宿主及中間宿主。為從源頭切斷新型冠狀病毒的傳播打下基礎。團隊同時比較2019-nCoV及其近緣冠狀病毒毒株S蛋白氨基酸序列，找出病毒變異及適應宿主受體分子重要位點，利用酵母雙雜交系統，篩選2019-nCov與宿主細胞互作分子，以期闡明2019-nCoV適應性進化機制并明確該新型冠狀病毒跨種間感染與傳播關鍵分子，為新型冠狀病毒感染的阻斷藥物制劑的研發及臨床核酸診斷和治療提供理論支撐。 基于2019-nCoV基因組分析及其跨種間傳播途徑的研究查看原文
江蘇大學
2021-04-10
SARS-CoV-2新途徑侵入宿主細胞的研究
2020年3月14日，空軍軍醫大學陳志南，朱平及邊惠潔共同通訊在預印版平臺bioRxiv 在線發表未經同行評審的題為“SARS-CoV-2 invades host cells via a novel route: CD147-spike protein”的研究成果，該研究發現SARS-CoV-2通過CD147的新途徑侵入宿主細胞：S蛋白與宿主細胞上的受體CD147結合，從而介導病毒入侵。因此，針對侵襲SARS-CoV-2宿主細胞的新途徑CD147-S蛋白的發現為特定抗病毒藥物的開發提供了關鍵目標。 首先，體外抗病毒試驗表明，抗CD147人源化抗體Meplazumab可顯著抑制病毒入侵宿主細胞，EC50為24.86μg/ mL，IC50為15.16μg/ mL；其次，該研究ELISA也證實了這兩種蛋白的結合；最后，通過免疫電子顯微鏡觀察到SARS-CoV-2感染的Vero E6細胞中CD147和S蛋白的定位。因此，針對侵襲SARS-CoV-2宿主細胞的新途徑CD147-S蛋白的發現為特定抗病毒藥物的開發提供了關鍵目標。
空軍軍醫大學
2021-04-11
穿山甲或是可能的潛在自然宿主的研究
云南大學省部共建云南生物資源保護與利用國家重點實驗室張志剛團隊一項關于馬來穿山甲不是新冠病毒中間宿主，而可能是與新冠病毒類似的病毒潛在自然宿主的研究結果，近日在Cell子刊《當前生物學》上正式發表。 2020年2月2日，張志剛研究員帶領的團隊對來自2019年3月24日無法救護成功的一只穿山甲肺樣本病毒組學數據進行重新組裝和全面分析，發現其攜帶有與新冠病毒相近的冠狀病毒，被命名為穿山甲冠狀病毒（Pangolin-CoV），這種病毒與新冠病毒以及武漢病毒所石正麗團隊報道的蝙蝠冠狀病毒的基因組相似性分別為91.02%和90.55%。研究發現，穿山甲冠狀病毒與新冠病毒的親緣關系僅次于蝙蝠冠狀病毒，但是穿山甲冠狀病毒與新冠病毒的S1功能基序高度一致，涉及與人類ACE2受體互作的五個關鍵氨基酸殘基完全一致，而蝙蝠冠狀病毒發生了四個突變，提示了穿山甲冠狀病毒與新冠病毒具有相似的宿主細胞識別能力。研究還發現在S1/S2酶切位點，新冠病毒含有中東呼吸綜合征冠狀病毒類似的Furin蛋白識別序列，而穿山甲冠狀病毒、蝙蝠冠狀病毒以及SARS冠狀病毒都缺失了該功能基序，表明新冠病毒與中東呼吸綜合征冠狀病毒具有相似的宿主細胞侵入機制。相關研究進展于2月15日第一時間上報到科技部“新型冠狀病毒感染的肺炎疫情應急攻關項目”，預印本于2月20日在bioRXiv上公布。2月26日，《自然-新聞》作了引用報道。3月19日Cell子刊《當代生物學》以“馬來穿山甲可能是類新冠病毒的潛在自然宿主”為題正式發表，研究數據可在相關平臺上自由獲取。 馬來穿山甲（Manis javanica）地理分布 張志剛研究團隊認為，從目前發現的中菊頭蝠、馬來穿山甲兩個可能的潛在源頭宿主分布區來看，中國華南也只是目前發現的可能潛在自然宿主之一的中菊頭蝠的部分分布區，現有研究不能確定新冠病毒的發生地，更不能表明新冠病毒起源于中國。 中菊頭蝠（Rhinolophus affinis）的地理分布 這項研究還首次全面澄清了新冠病毒與穿山甲冠狀病毒、蝙蝠冠狀病毒、SARS冠狀病毒以及中東呼吸綜合征冠狀病毒的關系，認為在蝙蝠和穿山甲之外，新冠病毒存在其它未知中間宿主，這為進一步攻克病毒源頭和傳播路徑提供了重要參考。對未來新冠病毒的溯源，張志剛研究團隊建議，可集中到與走私馬來穿山甲交叉分布的蝙蝠、食肉動物以及偶蹄類動物、嚙齒類類動物及其自然分布區展開全面調查采樣，以及集中到與中菊頭蝠交叉分布的食肉動物、偶蹄類動物、嚙齒類動物及其自然分布區展開全面調查采樣。查看原文
云南大學
2021-04-11
穿山甲或為新冠病毒潛在中間宿主的研究
2020年2月7日，華南農業大學、嶺南現代農業科學與技術廣東省實驗室舉行新聞發布會。嶺南現代農業科學與技術廣東省實驗室、華南農業大學教授沈永義、肖立華等科研人員通過聯合攻關，在新型冠狀病毒潛在中間宿主的溯源上取得重大突破。最新研究表明穿山甲為新型冠狀病毒的潛在中間宿主。這一最新發現將對新型冠狀病毒的源頭防控具有重大意義。 攻關團隊通過分析1000多份宏基因組樣品，鎖定穿山甲為新型冠狀病毒的潛在中間宿主；繼而通過分子生物學檢測，揭示穿山甲中β冠狀病毒的陽性率為70%；進一步對病毒進行分離鑒定，電鏡下觀察到典型的冠狀病毒顆粒結構；最后通過對病毒的基因組分析，發現分離的病毒株與目前感染人的毒株序列相似度高達99%。 以上結果表明穿山甲為新型冠狀病毒的潛在中間宿主。研究結果對本次疫情的源頭防控具有重大意義，也對野生動物管控的相關政策調整提供科學依據。
華南農業大學
2021-04-10
改造類脂 A 結構用于安全宿主菌構建及疫苗佐劑生產
類脂 A 是脂多糖分子的疏水基團，大量存在于革蘭氏陰性細菌的外膜外層，能通過結合免疫細胞表面的受體 TLR4 來刺激人體免疫系統[50, 51]，因而也是一種很好的免疫系統激活因子。美國 Corexa 公司已經開發出了可用于乙肝病毒疫苗和過敏治療的疫苗佐劑 MPL。研究表明 MPL 刺激的免疫細胞中 IL-1β 的分泌量 顯著降低，使得 MPL 的毒性降低但免疫活性還在。MPL 目前是通過從沙門氏菌的 突變株 Salmonella minnesota RC595 中提取類脂 A，然后用化學方法去除其多余的附加基團而得到。本項目擬利用這些類脂 A 修飾酶，根據類脂 A 分子的合成機理，通過基因工程技術將大腸桿菌中類脂 A 的結構改造成為 MPL，構建能合成 MPL 的大腸桿菌。這種新型的能合成 MPL 的大腸桿菌不僅可以作為宿主菌安全使用于食品和藥物的發酵工業生產中，而且可以作為實驗室研究中更安全的基因表達載體，最重要的是它可以直接用來生產類脂 A 疫苗佐劑 MPL
江南大學
2021-04-11
病毒與宿主/傳播機制/增值/演化研究NMT工作站
“NMT界喬布斯”許越先生推薦創新平臺
中關村NMT產業聯盟推介成員單位創新產品
“生物安全，人人有責”
推出背景：
在國際競爭白熱化，戰爭形態多樣化的今天，生物安全已成為國家安全的重要組成部分，為積極應對這一挑戰，2019年10月，生物安全法草案于首次提請十三屆全國人大常委會第十四次會議審議。本次新冠肺炎疫情的爆發，讓各界更加意識到，生物安全對于確保國家安全、保障社會穩定、人民群眾生命安全和身體健康的重要性。
國家安全就是國家競爭，歸根結底又是科技實力的競爭！因此，作為中國的高新技術企業，中關村NMT聯盟的會員單位，旭月（北京）科技有限公司利用20多年的技術積累，以NMT：非損傷微測技術為底層核心技術，迅速推出了與國家生物安全相關多種檢驗，監測儀器設備，以及適用于多個學科及領域的研發平臺：
《NMT生物安全創新平臺》特制系列產品！
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應對挑戰：
1）簡單化：病毒與宿主之間相互作用的過程非常復雜，通過NMT檢測宿主生理指標的動態數據，展示病毒入侵宿主內部的過程。
2）宿主細胞原位檢測：NMT不僅可以檢測單細胞，還可以實現對細胞的原位檢測，結果更貼近體內的真實情況。
分類及用途：
1）《病毒與宿主互作研究NMT工作站》（型號：NMT-VHI-100）
基于底層核心NMT技術，以及成熟的技術解決方案，讓科研人員可以馬上投入相關科研創新工作。
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2）《病毒與宿主互作研究NMT工作站》（型號：NMT-VHI-200）
基于底層核心NMT技術，結合自身科研興趣，以及其它相關技術參數，在我方技術人員協助下形成技術解決方案，讓科研人員建立更具獨有創新特色的實驗平臺。
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《病毒與宿主互作研究NMT工作站》（型號：NMT-VHI-100）
應對挑戰：
1）簡單化：病毒與宿主之間相互作用的過程非常復雜，通過NMT檢測宿主生理指標的動態數據，展示病毒入侵宿主內部的過程。
2）宿主細胞原位檢測：NMT不僅可以檢測單細胞，還可以實現對細胞的原位檢測，結果更貼近體內的真實情況。
用途：
基于底層核心NMT技術，以及成熟的技術解決方案，讓科研人員可以馬上投入相關科研創新工作。
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參數：
1.基本功能：
1.1針對病毒與宿主互作研究設計
1.2活體、原位、非損傷檢測
1.3可檢測指標：H+、K+、Na+、Ca2+、Mg2+、Cl-、O2、H2O2
2.性能：
2.1自動化操作
2.2長時間實時和動態監測
2.3無需標記
2.4立體3D流速檢測
3.軟件：
3.1imFluxes智能軟件，可直接檢測、輸出離子分子的濃度與流速
《病毒與宿主互作研究NMT工作站》（型號：NMT-VHI-200）
應對挑戰：
1）簡單化：病毒與宿主之間相互作用的過程非常復雜，通過NMT檢測宿主生理指標的動態數據，展示病毒入侵宿主內部的過程。
2）宿主細胞原位檢測：NMT不僅可以檢測單細胞，還可以實現對細胞的原位檢測，結果更貼近體內的真實情況。
用途：
基于底層核心NMT技術，結合自身科研興趣，以及其它相關技術參數，在我方技術人員協助下形成技術解決方案，讓科研人員建立更具獨有創新特色的實驗平臺。
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參數：
1.基本功能：
1.1針病毒與宿主互作研究和研發設計
1.2活體、原位、非損傷檢測
1.3可檢測指標：H+、K+、Na+、Ca2+、Mg2+、Cl-、O2、H2O2
1.4可實時監測和記錄檢測時的環境參數：溫度、濕度、大氣壓、海拔、經緯度
1.5配備新指標拓展功能
2.性能：
2.1自動化操作
2.2長時間實時和動態監測
2.3無需標記
2.4立體3D流速檢測
3.軟件：
3.1imFluxes智能軟件，可直接檢測、輸出離子分子的濃度與流速，以及檢測時的環境參數
旭月（北京）科技有限公司
2021-08-23
龜類可能是新冠肺炎潛在中間宿主的研究
2月26日，暨南大學吳建國課題組與湖北醫藥學院附屬人民醫院的劉龍在期刊Medical Virology上發表論文稱，龜類（西部錦龜、綠海龜、中華鱉）也是潛在的新冠病毒中間宿主。研究者對比新冠病毒與SARS病毒、動物樣本中發現的SARS樣冠狀病毒以及其他冠狀病毒之間的刺突蛋白（S）指出，這一位于病毒外殼上的結構蛋白與新冠病毒侵入細胞所使用的ACE2受體間的相互作用，是決定冠狀病毒宿主范圍的關鍵因素。論文稱，通過低溫電子顯微鏡分析新冠病毒刺突蛋白的結晶體，有助于驗證該蛋白與人類或其他宿主細胞間相互作用的結合點。研究團隊從多個數據庫中下載了ACE2受體與上述病毒的刺突蛋白序列。結構模擬中，就刺突蛋白結合作用點中一個殘基（Asn501）與ACE2受體上的兩個位點（41與353）的相互作用來看，比起蝙蝠，龜類與穿山甲與人類的更為近似。論文指出，目前已知龜類作為寄主能攜帶包括虹蛙病毒（RV）、尼多病毒（NV）、乳頭瘤病毒（PV）、甲魚虹彩病毒（STIV）、甲魚系統性敗血癥球狀病毒（STSSSV）、龜細小核糖核酸病毒（ToPV）和中華鱉出血綜合征病毒（TSHSV）等多種病毒。此外，與禁止交易的穿山甲相比，動物市場上龜類更為普遍。研究者認為，不能排除病毒感染龜類、演化后感染人類的可能。
湖北醫藥學院
2021-04-10
沈建忠院士團隊在宿主導向抗菌化合物發現方向發表研究綜述
作者指出HACs并非直接作用于病原菌，相對較小的選擇壓力使得細菌更不易產生耐藥性，在未來的耐藥菌防控中將扮演重要角色。
中國農業大學
2022-06-01
人腸道病毒D68蛋白酶2A靶向TRAF3破壞宿主天然免疫應答機制
11月4日，天津大學生命科學學院王濤課題組在Journal of Virology在線發表了最新研究成果，論文題目為“Enterovirus D68 Protease 2AproTargets TRAF3 to Subvert Host Innate Immune Responses”。 腸道病毒EV-D68（Enterovirus D68）可引起典型上呼吸道感染癥狀，同時還會誘發中樞神經系統疾病，如急性弛緩性麻痹和急性無力脊髓炎等。近年來，我國對EV-D68的檢出率逐漸升高，存在大規模暴發的風險。腸道病毒的非結構蛋白2A蛋白酶（2Apro）是協助病毒逃避宿主天然免疫的關鍵蛋白。 王濤團隊發現在感染EV-D68后，2Apro可顯著抑制SEV誘導的Ⅰ型干擾素反應。進一步研究發現，2Apro能夠分別在HeLa和HEK293T細胞中切割TRAF3的C端區域，切割后得到的條帶大小為40 kDa左右。同時，2Apro中第107位氨基酸的半胱氨酸被丙氨酸取代后，喪失對TRAF3的切割活性，而TRAF3中第462位氨基酸甘氨酸突變為丙氨酸時，表現出對2Apro切割的抗性。 本研究發現了EV-D68的2Apro能夠切割宿主天然免疫通路中的TRAF3蛋白，從而破壞宿主的先天免疫應答，并對2Apro和TRAF3切割的具體位點和機制做了詳細報道。
天津大學
2021-02-01
人腸道病毒D68蛋白酶2A靶向TRAF3破壞宿主天然免疫應答機制
項目成果/簡介:11月4日，天津大學生命科學學院王濤課題組在Journal of Virology在線發表了最新研究成果，論文題目為“Enterovirus D68 Protease 2AproTargets TRAF3 to Subvert Host Innate Immune Responses”。 腸道病毒EV-D68（Enterovirus D68）可引起典型上呼吸道感染癥狀，同時還會誘發中樞神經系統疾病，如急性弛緩性麻痹和急性無力脊髓炎等。近年來，我國對EV-D68的檢出率逐漸升高，存在大規模暴發的風險。腸道病毒的非結構蛋白2A蛋白酶（2Apro）是協助病毒逃避宿主天然免疫的關鍵蛋白。 王濤團隊發現在感染EV-D68后，2Apro可顯著抑制SEV誘導的Ⅰ型干擾素反應。進一步研究發現，2Apro能夠分別在HeLa和HEK293T細胞中切割TRAF3的C端區域，切割后得到的條帶大小為40 kDa左右。同時，2Apro中第107位氨基酸的半胱氨酸被丙氨酸取代后，喪失對TRAF3的切割活性，而TRAF3中第462位氨基酸甘氨酸突變為丙氨酸時，表現出對2Apro切割的抗性。 本研究發現了EV-D68的2Apro能夠切割宿主天然免疫通路中的TRAF3蛋白，從而破壞宿主的先天免疫應答，并對2Apro和TRAF3切割的具體位點和機制做了詳細報道。
天津大學
2021-04-11