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哈爾濱醫科大學由我國醫學先驅伍連德博士于1926年創建的哈爾濱醫學專門學校和興山中國醫科大學第一、二分校組建而成。學校歷經90余年的發展建設，傳承伍連德博士“赤誠愛國、自強創業”的奉獻精神，發揚中國工農紅軍衛生學?！罢螆远?、技術優良”的光榮傳統，秉承“木直中繩、博學載醫”的校訓，綜合實力不斷增強，具有相當的發展規模和鮮明的辦學特色。學校是部委省共建大學、黑龍江省高水平大學和優勢特色學科建設高校、中俄醫科大學聯盟中方牽頭單位、國家理科基礎科學研究與教學人才培養基地、教育部第一批卓越醫生教育培養計劃項目試點高校。
學校設18個二級院部和8個事業單位?，F有教職工17,089人。有中國工程院院士2人，獲南丁格爾獎1人，國務院學科評議組成員3人，教育部高等學校教學指導委員會委員18人，全國醫學專業學位研究生教育指導委員會委員3人；有國家級教學名師4人，“國家杰青”2人，“國家優青”1人，入選“萬人計劃”6人、“長江學者”9人，享受國務院政府特殊津貼89人，博士生導師331人。
學校校本部設有16個本科招生專業，涵蓋醫學、理學、工學、法學、管理學5個學科門類。國家特色專業有臨床醫學、麻醉學、醫學影像學、預防醫學、藥學專業，入選國家一流本科專業建設點的專業有基礎醫學、臨床醫學、口腔醫學、預防醫學、臨床藥學、護理學、公共事業管理專業。校本部在校普通教育本科生7,945人，研究生5,799人，留學生685人。
學校擁有博士學位一級學科授權點9個（基礎醫學、臨床醫學、公共衛生與預防醫學、生物學、生物醫學工程、公共管理、藥學、護理學、口腔醫學），二級學科授權點62個；碩士學位一級學科授權點11個，二級學科授權點64個；博士后科研流動站5個。擁有國家重點學科2個、國家重點培育學科1個，國家臨床重點?？平ㄔO項目33個。在第四輪學科評估中，1個學科進入A類（A-）、8個學科進入B類（2個B+、3個B、3個B-）。有國際合作聯合實驗室2個，省部共建國家重點實驗室培育基地1個，教育部重點實驗室4個，衛健委重點實驗室3個，省級重點實驗室13個，省普通高校重點實驗室11個。學校有4所直屬附屬醫院，均為“三級甲等”醫院和全國“百佳醫院”。
學校有國家級實驗教學示范中心4個，國家級虛擬仿真實驗教學中心1個?！笆濉币詠?，主編教育部、衛健委規劃教材及再版規劃教材39部。獲批教育部卓越醫生教育培養計劃改革試點項目3項。獲國家視頻公開課程4門，國家資源共享課程12門，國家精品在線開放課程1門。共獲國家級教學成果獎16項，省級教學成果獎139項。
“十二五”以來，學校獲得各類科研項目9,351項，主持國家重點基礎研究發展計劃（“973”計劃）1項，國家高技術研究發展計劃（“863”計劃）1項，國家科技重大專項1項、國家重點研發計劃專項3項，國家自然科學基金1,384項。獲各種獎勵962項，其中，國家科學技術進步獎二等獎1項、高等學校科學研究優秀成果獎（科學研究）一等獎5項、中華醫學科技獎一等獎2項、中國專利獎優秀獎1項。獲國家自然科學基金委員會創新研究群體項目1項、教育部科技創新團隊2個。
抗心律失常藥物作用最佳靶點的研究，中國人類基因組計劃研究，精準肝臟外科技術研究，同種異體劈裂脾移植研究，三氧化二砷治療M3型白血病和治療實體瘤的研究，大骨節病病因學研究，心臟移植、雙手移植、單前臂移植和大腸癌綜合治療等在國內外具有較大的影響。
主辦《中國地方病學雜志》、《國際遺傳學雜志》、《國際免疫學雜志》、《哈爾濱醫科大學學報》等6種專業雜志。先后同美國、日本、加拿大、英國、澳大利亞、俄羅斯、德國、韓國等10余個國家的百余所院校和研究機構建立了友好合作關系。
學校堅持以高水平的醫學本科教育為基礎，以學科建設為根本，優先發展研究生教育和長學制醫學教育的辦學思想，突出辦學特色，加快推動一流大學和一流學科建設，努力打造百年醫學強校，奮力譜寫國內一流、國際有影響的高水平醫科大學的美好篇章！