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新疆應用職業技術學院是根據經濟社會發展和高校布局調整的需要，2012年初經自治區人民政府批準成立、國家教育部備案的一所獨立設置的以培養應用型、技能型人才為主的公辦全日制普通高等職業院校。
學院自1974年6月成立的農七師師范學校起，歷經奎屯師范學校、伊犁州奎屯師范學院、伊犁州教師進修學院、伊犁教育學院、伊犁師范學院奎屯校區。經過四十年的發展，先后培養各類學生30000余名，為新疆和伊犁哈薩克自治州的經濟建設、社會發展和教育事業做出了應有的貢獻。曾先后獲得“全國民族教育先進集體”、“全國成人高等教育先進學?！?、“全國學校藝術教育工作先進單位”等榮譽稱號。
2014年8月，學院與塔城地區行政公署簽訂了《托管協議》，托管了塔城地區衛生學校和塔城地區烏蘇職業技術學校，促進了資源共享，實現了優勢互補，拓展了學院發展空間。學院現分為奎屯校區、烏蘇南校區和烏蘇北校區三個校區，占地1949畝，校舍建筑總面積21萬多平方米，圖書藏量30萬冊，教學用計算機1463臺，語音教室144座，網絡多媒體教室76間。學院有教職工453人，其中專任教師338人。教師中正高職稱3人，副高職稱75人，碩士以上學位105人，雙師型教師100人。現設有65個高職高專專業，28個中專中職專業，全日制在校生9000多人，成人本?？平?000人。
學校積極推進教學基礎設施和實訓基地建設，在烏蘇南校區建設了5萬多平方米的各類教學場所，建設了護理、旅游、電子商務，物流管理、建筑工程等專業校內實訓室;在烏蘇北校區建設了包括焊接、數控、汽車實訓在內的7990平方米的實訓車間、機械制造與自動化專業實訓基地;在奎屯校區新建了4000平方米學生餐廳和塑膠運動場，建設了園林技術實習基地和學前教育專業等校內實習實訓室。引進社會資金800多萬元初步完成了奎屯校區和烏蘇南校區數字化校園網建設項目和校園智能一卡通建設項目，校園信息化水平明顯提升。
學院重視學生實踐動手和創新能力培養，與奎屯市聯建了大學生創業就業園，免費為有志自主創業的學生提供場地、設施和相關培訓;設有伊犁州第二國家職業技能鑒定所，可以為學生提供48個工種的初、中、高級培訓鑒定工作。學生綜合素質不斷增強，就業能力不斷提高。在全國英語技能大賽、全國挑戰杯大賽和自治區職業技能大賽中獲獎，2016年畢業生年終就業率92%。