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新疆農業大學科學技術學院成立于2002年7月，是經國家教育部批準的實施本科層次普通高等教育的獨立學院。
學院位于烏魯木齊市農大路110號，校園環境優雅，基礎設施齊全，辦學條件先進，師資力量雄厚，是新疆首批獲得教育部批準舉辦的獨立學院。
學院采用全新的教育理念，新型管理體制和運行機制，實行全員聘任和崗位負責制。根據精干高效的原則，注重能力，按需設崗，獨立開展教學、學生管理及學院建設發展等各項工作，積極構建“學院自主、社會參與、市場介入、政府調控”的良性互動發展環境。學院設有語言文學與教育學部、經濟與商業學部、管理與法律學部、信息與工學學部、生物學部等5個專業教學部以及綜合管理部、教務管理部、學生管理部、招生就業辦公室、資產管理部、財務管理部、實踐教學中心、教學督導辦公室、校園管理中心等9個行政機構。
學院依托新疆農業大學的學科基礎和師資優勢，根據地方和區域社會經濟建設及城市化、城鎮化發展需要，結合西部大開發，努力創造條件，加快發展社會急需專業。目前設有經濟學類、生物科學類、電子信息科學類、土建類、管理科學與工程類等5個專業大類22個本科專業。學院現聘任專職教師305人，其中教授35人，副教授105人，具有博士學位教師32人，碩士學位115人，現有在校學生2850人。
學院面向全國招生。學生畢業后由新疆農業大學科學技術學院授予國家統一印制的畢業證書；符合規定者，經學位委員會審批，授予新疆農業大學科學技術學院學士學位證書。
學院成立以來，以獨立地組織實施教學為原則，開展人才培養模式改革，加強教學管理制度建設，實行“學分制”教學管理制度，實施“按大類招生，兩段式培養” 模式，推行“學歷證書與職業資格證書相結合”制度，采取“課內學習與課外網絡和閱讀學習并舉”措施，建立健全教學質量監控體系，形成了學院鮮明的教學特色。學院擁有一支高素質的專職學生工作隊伍，制定了嚴格的管理制度，引導學生黨團組織和學生會組織開展了豐富多彩的課余活動，為學生提供了施展才華的天地；設立了多項獎學金，建立競爭激勵機制，并采取獎、助、勤、貸等多種形式為貧困生解決實際困難。學院完善的教學計劃、嚴格的教學管理、嚴謹的工作作風和良好的校園文化得到了自治區教育廳的充分肯定和社會各界的高度評價。
依托新疆農業大學雄厚的辦學實力，繼承和發揚“艱苦奮斗，勤奮開拓”的優良傳統，新疆農業大學科學技術學院將以致力于為國家經濟建設和社會發展培養高素質的應用型創新人才為己任，逐步積累辦學經驗，不斷完善辦學條件，因材施教，嚴格管理，努力將學院建成一所擁有現代化辦學設施，具有鮮明辦學特色，適應國家經濟發展和現代化城市建設，具有較高辦學水平的地方一流綜合性高等學校。