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利用A-to-I RNA編輯揭示miRNA及其反義RNA的相互調(diào)控網(wǎng)絡
利用A-to-I RNA編輯作為miRNA反義鏈表達的有利證據(jù)。通過靶向RNA測序技術，宋玉龍和李麗詩等利用A-to-I RNA編輯推導鏈表達的方向，揭示了miRNA基因座反義RNA的廣泛表達和編輯現(xiàn)象。宋玉龍和李麗詩等發(fā)現(xiàn)miRNA和其反義RNA形成了一個相互調(diào)控的網(wǎng)絡：miRNA可以下調(diào)其反義RNA的表達水平；反義RNA在轉錄水平和轉錄后水平調(diào)控miRNA的表達和加工。此外，A-to-I RNA編輯可以穩(wěn)定反義RNA的結構，避免其被配對的miRNA所降解。這一研究揭示了前人所未知的miRNA反義鏈編輯現(xiàn)象的廣泛性，為RNA編輯的研究開辟了新的研究方向。
中山大學
2021-04-13
一種光控RNA標記新技術
研究開發(fā)了 “ 熒光團輔助的 RNA 鄰近標記和測序技術 ” ，簡稱 “CAP-seq” 。 該方法通過可見光激發(fā)遺傳靶向的光敏蛋白 miniSOG 產(chǎn)生活性氧， 介 導鄰近 RNA 分子上的鳥嘌呤與具有生物正交功能把手的氨基探針進行共價交聯(lián)，既而通過富集純化與高通量測序檢測，實現(xiàn) miniSOG 定位的亞細胞區(qū)域內(nèi) 轉錄 組的空間特異性標記與鑒定。 利用 CAP-seq ，他們系統(tǒng)研究了幾個亞細胞區(qū)域的轉錄組，包括線粒體基質(zhì)轉錄組 、 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)表面 轉錄組 以及 線粒體外膜附近轉錄組。這些研究結果表明 CAP-seq 對 活細胞中開放區(qū)域的 RNA 標記具有良好的空間特異性和覆蓋度 。 他們在線粒體外膜附近檢測到 30 個編碼氧化磷酸化途徑相關蛋白的 RNA 和多達 55 個編碼核糖體蛋白的 mRNA ，這一結果不僅支持了線粒體蛋白在線粒體外膜被翻譯后直接轉運進線粒體的模型，還暗示著線粒體功能可能與蛋白質(zhì)的翻譯調(diào)節(jié)有關。 CAP-seq 具有操作簡單、空間選擇性高、生物相容性好的特點，將成為一項適合于在多種生物系統(tǒng)中研究亞細胞 轉錄組 的新技術。
北京大學
2021-04-11
蛋白-蛋白及?RNA-蛋白質(zhì)相互作用成像新技術
已有樣品/n本發(fā)明涉及蛋白-蛋白及RNA-蛋白質(zhì)相互作用成像領域，基于激發(fā)波長在600nm以上的紅色熒光蛋白mNeptune熒光片段互補技術，建立了位于活體成像“光學窗口”的雙分子和三分子熒光互補系統(tǒng)。其中雙分子熒光互補系統(tǒng)可以用于活細胞及活體內(nèi)蛋白-蛋白相互作用成像，三分子熒光互補系統(tǒng)可以用于活細胞及活體內(nèi)RNA-蛋白質(zhì)之間的相互作用成像。該成果為首次建立活體內(nèi)RNA-蛋白質(zhì)相互作用熒光成像技術，該技術也將有助于開發(fā)活細胞及活體內(nèi)藥物評價體系和藥物篩選平臺。
中國科學院大學
2021-01-12
技術需求：用于miRNA檢測的技術
一般miRNA長度為22個堿基，當其中一半的序列(即11個堿基)與其對應的核酸探針雜交時， miRNA與探針之間只能產(chǎn)生比較弱的結合，若當中出現(xiàn)錯配和部分互補的情況，目標miRNA與探針之間的結合作用減弱，需要一種技術反復沖洗去除核酸探針與目標miRNA之間出現(xiàn)錯配和部分互補的結合，提高檢測體系的特異性。
南昌瑞奧聚成生物技術有限公司
2021-10-29
一種miRNA 2861反義核苷酸藥物組合物及其用途
本發(fā)明涉及一種miRNA 2861反義核苷酸藥物組合物及其用途。miRNA 2861的反義核苷酸序列為5’ CCGCCCGCCGCCAGGCCCC 3’；藥物組合物包括感染滴度為10<sup>16</sup> PFU過表達miRNA 2861反義核苷酸載體、病毒或輔料，所述載體為膽固醇、納米顆粒或脂質(zhì)體；病毒載體為腺病毒載體、慢病毒載體、逆轉錄病毒載體中的一種或多種；所述輔料為甘露醇、磷酸鹽緩沖液、生理鹽水中的一種或多種。通過口服或注射用于預防和治療心肌肥厚、心肌纖維化、冠心病和心衰。本發(fā)明藥物組合物配方合理，藥理可靠，制作工藝簡單，治療效果明顯，應用范圍廣，使用環(huán)境友好。
青島大學
2021-04-13
一種與肝癌相關的非編碼RNA生物標志物及其應用
肝癌（Hepatocellular carcinoma, HCC）是全球第五大常見的消化道惡性腫瘤，也是全球第三大致死性癌癥。我國肝癌病發(fā)率位居全球首位，肝癌已成為嚴重威脅我國人民健康和生命的疾病。由于肝癌的早期診斷缺乏可靠的生物標志物，肝癌患者通常在肝癌晚期才被診斷，其5年生存率僅為15%。目前肝癌診斷主要依賴于影像學檢查或者血液活檢中的甲胎蛋白（AFP）標志物等手段。但這些傳統(tǒng)方法對于癌變早期存在敏感性低、特異性低等局限性，例如，血液活檢中的甲胎蛋白特異性差，且往往到癌癥晚期才能檢測到其含量升高，可能延誤最佳的治療時機。因此亟需找到一種可用于肝癌診斷及預后的可靠的新型液體活檢標志物。 液體活檢為一門新型的檢測技術，越來越受到關注。目前可以作為無創(chuàng)檢測的生物標志物大多數(shù)是蛋白質(zhì)分子和DNA分子，但這些標志物在靈敏度、誤診率和經(jīng)濟成本高等方面的缺陷導致它們很難被普及。RNA分子在細胞中擁有多個拷貝并且存在多種轉錄調(diào)控形態(tài)，可以更加準確地反映細胞狀態(tài)和癌癥動態(tài)發(fā)展過程，而且其檢測成本也很低。 過去體液中的RNA標志物研究主要集中在miRNA等小RNA的研究，相對于細胞中大量的長RNA，miRNA的數(shù)量要少一個到兩個數(shù)量級，因此提供的信息也有限。本項目另辟蹊徑，通過對大量肝癌患者（HCC）、慢性乙型肝炎患者(CHB)和健康個體(HD)進行血漿中非編碼RNA表達譜的高通量測序檢測和分析，發(fā)現(xiàn)了一種非編碼RNA，srpRNA (RN7SL1)，的功能結構域可以穩(wěn)定存在于血液中，并在區(qū)分肝癌患者和陰性對照組時具有良好的敏感度和特異性（約90%）。并且，通過在獨立驗證集上的實時熒光定量檢驗（RT-qPCR），該srpRNA (RN7SL1)的功能結構域被證明在 肝癌的診斷及預后方面都具有可靠的臨床表現(xiàn)。
清華大學
2021-02-01
一種與肝癌相關的非編碼RNA生物標志物及其應用
項目成果/簡介:肝癌（Hepatocellular carcinoma, HCC）是全球第五大常見的消化道惡性腫瘤，也是全球第三大致死性癌癥。我國肝癌病發(fā)率位居全球首位，肝癌已成為嚴重威脅我國人民健康和生命的疾病。由于肝癌的早期診斷缺乏可靠的生物標志物，肝癌患者通常在肝癌晚期才被診斷，其5年生存率僅為15%。目前肝癌診斷主要依賴于影像學檢查或者血液活檢中的甲胎蛋白（AFP）標志物等手段。但這些傳統(tǒng)方法對
清華大學
2021-01-12
基于圖的反欺詐分析框架
本項目開發(fā)的流量預測系統(tǒng)，主要功能是預測未來某一天的資金流量，設計了一套深度學習系統(tǒng)用來精確預測未來某天的資金流量
中山大學
2021-04-10
植物新生RNA的剪切動力學
內(nèi)含子是基因中不具有編碼作用的片段，它會被轉錄到前體RNA中，但在mRNA加工過程中被剪切掉，而內(nèi)含子剪切是真核生物mRNA成熟的關鍵步驟。在酵母中，當RNA聚合酶II(Pol-II)轉錄到內(nèi)含子下游45nt時已經(jīng)有一半的內(nèi)含子完成了剪切。但高等真核生物，尤其植物中RNA共轉錄剪切速率，剪切狀態(tài)和其他RNA加工過程之間的關系又是什么樣的呢？為解答這一疑惑，翟繼先課題組開展了系列研究分析。
南方科技大學
2021-04-14
揭示RNA編輯核心蛋白ADAR全轉錄組RNA底物特征
開發(fā)了一個高效的捕獲RNA結合蛋白雙鏈RNA底物的建庫測序技術（irCLASH）以及后續(xù)的一整套生物信息學分析方法；首次在轉錄組水平上系統(tǒng)地繪制了人類ADAR蛋白的內(nèi)源雙鏈RNA底物圖譜；揭示了決定ADAR結合效率和編輯效率的底物特征和ADAR結合長雙鏈RNA的體內(nèi)模型。 該研究利用irCLASH技術系統(tǒng)構建和分析了人類ADAR1、ADAR2及ADAR3的雙鏈RNA底物圖譜，發(fā)現(xiàn)與之前根據(jù)計算推導的研究設想不同，ADAR具有大量的、長距離的雙鏈RNA底物。該研究發(fā)現(xiàn)不完全互補配對的底物與ADAR蛋白也有很好的親和度，特別是ADAR2家族成員。研究還進一步揭示了決定ADAR結合效率和編輯效率的底物特征。irCLASH測序技術及后續(xù)的整套生物信息學分析方法的開發(fā)為研究雙鏈RNA結合蛋白的內(nèi)源底物提供了新的工具。同時，該研究揭示的ADAR與底物相互作用及催化特性為研究人員開發(fā)高效的RNA編輯工具提供了資源寶庫及改進方向。
中山大學
2021-04-13