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提出并發(fā)展了一種蛋白質(zhì)“鄰近脫籠”策略，將可遺傳編碼的非天然氨基酸脫籠技術(shù)與計算機輔助設(shè)計篩選技術(shù)相結(jié)合，在一系列不同種類的蛋白質(zhì)上實現(xiàn)了高時間分辨的原位激活，為在活細胞及活體動物內(nèi)研究蛋白質(zhì)的動態(tài)調(diào)控機制提供了一種普適性技術(shù)。利用這一被命名為 CAGE-prox 的新方法，他們建立并驗證了“激酶正交激活和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)調(diào)控”、   “時間分辨的蛋白質(zhì)組學分析”，“基于毒素蛋白的抗腫瘤蛋白前藥”等一系列原創(chuàng)應(yīng)用，展示了這一化學生物學新技術(shù)在開展蛋白質(zhì)動態(tài)功能研究與調(diào)控中的優(yōu)勢和特色。“化學脫籠”策略，可通過對蛋白質(zhì)關(guān)鍵殘基的化學保護和脫保護反應(yīng)，實現(xiàn)對其活性的“關(guān)－開”調(diào)控（Nat. Chem. Biol. 2016, 12, 129）。利用這一技術(shù)，他們先后在賴氨酸（Nat. Chem., 2014, 6, 352; Nat. Chem. Biol., 2014, 10, 1003）、酪氨酸（J. Am. Chem. Soc., 2016, 138, 15118）等天然氨基酸側(cè)鏈上實現(xiàn)了生物正交斷鍵反應(yīng)和化學脫籠，開展了激酶等蛋白質(zhì)家族的特異激活和機制研究（ACS Cent. Sci, 2016, 2, 325，ACS Cent. Sci. 2019, 5, 145）。由于細胞內(nèi)蛋白質(zhì)的種類繁多、活性調(diào)控機制各異，目前該方法仍受可供脫籠的氨基酸種類限制，無法適用于所有蛋白質(zhì)。

真菌疏水蛋白具有自我裝配成膜的性質(zhì)，因此 （1）疏水蛋白可作為蛋白和細胞固定化的媒介，可用于生物傳 感器和生物芯片，作為引發(fā)層，交聯(lián)上配體或形成融合蛋白，能使特 定分子固定化到特定表面。 （2）它能改變表面的屬性，保護表面。可用于提高醫(yī)學器官移 植物生物相容性和防止微生物細胞粘附；可應(yīng)用于醫(yī)藥行業(yè)中燒傷、 創(chuàng)傷的創(chuàng)面保護，為臨床病人創(chuàng)面保護和恢復(fù)提供一種安全無毒、操 作簡便、高效低耗的新手段。 （3）作為一種生物表面活性劑，疏水蛋白還可以用于促進土壤 中的污染物的降解和應(yīng)用在石油泄漏后回收石油的過程中。 （4）疏水蛋白具有表面活性，可用于食品對抗相變能力并形成 穩(wěn)定泡沫，使其在密封食品生產(chǎn)上發(fā)揮重要作用； （5）也可用于日用化妝品生產(chǎn)中，因疏水蛋白可以作為洗潔產(chǎn) 品的成分，根據(jù)其疏水、親水兩相間的轉(zhuǎn)變，可通過自我裝配而將面 部的油脂等疏水的成分包裹起來，再用水清洗將其除去，也可以作為 保護秀發(fā)的天然膜，使發(fā)部維持清潔并保持一定水分；將它運用到面 部的美容護理，由于它的特性，能使皮膚表面形成一層天然生物活性 保護膜，起到皮膚保濕、免受外界空氣中污濁物的侵害，從而達到護膚美容之功效。 （6）疏水蛋白直接包裹藥物以改變藥物溶解性并實現(xiàn)控、緩釋。 通過真菌疏水蛋白與難溶于水的藥物混合，可以達到良好的分散效果， 并延長了兩種藥物的藥效持續(xù)時間。 （7）真菌疏水蛋白與其他的功能性蛋白或小肽組成融合蛋白， 同時發(fā)揮疏水蛋白的穩(wěn)定吸附材料表面的特性和功能性蛋白或小肽 的特異性功能，如在組織工程、抗炎抗菌材料等。 項目特色： 純天然生物制品，無毒害，無污染。耐酸堿，抗相變能力強。自 我裝配形成有活性的蛋白膜。具有良好的熱穩(wěn)定性和透氣不透水性。 由于它的特性，使得它具有：（1）自動成膜，無需貼敷，使用便利； （2）透氣性優(yōu)良；(3)純天然無化學添加成分，瑞氏木霉已被證明是 安全的菌種；（4）組織相容性好，避免了嚴重的排異反應(yīng)；（5）耐高 溫（100 攝氏度仍保持活性），易于消毒；（6）穩(wěn)定不降解，便于產(chǎn)品 的長期保存；（7）用表面活性劑就可以很容易地清洗（8）延展性好， 1 毫克的疏水蛋白在液面就可以展開 1 平方米的薄膜（9）透明，可直 接透過成膜觀察（10）性價比高。 市場應(yīng)用前景： 目前國際上尚未實現(xiàn)疏水蛋白的工業(yè)化生產(chǎn)，其相關(guān)應(yīng)用產(chǎn)品的 開發(fā)更為滯后。我們在已實現(xiàn)疏水蛋白中試研發(fā)的基礎(chǔ)上，擴大發(fā)酵 規(guī)模，進行后續(xù)產(chǎn)品的開發(fā)，我們的技術(shù)和工藝現(xiàn)居國際領(lǐng)先地位， 無疑會占有寶貴的先機。 疏水蛋白產(chǎn)品將作為新一代膜生物活性材料進入市場，它的出現(xiàn) 將會革命性地取代現(xiàn)有化學產(chǎn)品，這無疑給人類的健康帶來了很大的 益處，消除人類在預(yù)防和治療疾病、食品加工、以及醫(yī)學檢測、食物保鮮方面為健康做出努力的同時給自身帶來的潛在危害，而且價格更 為低廉。因此，本項目大規(guī)模生產(chǎn)疏水蛋白及其應(yīng)用開發(fā)是有非常廣 闊的市場前景的，并且我們的技術(shù)在國際和國內(nèi)市場處于領(lǐng)先地位。 這些產(chǎn)品都將在國際市場上處于最優(yōu)競爭狀態(tài)。

通過計算機虛擬篩選和建立熒光共振能量轉(zhuǎn)移的體外高通量篩選體系，篩選得到新型的ATG4B小分子抑制劑S130。通過對自噬信號通路的研究，發(fā)現(xiàn)S130不影響自噬體功能及其與溶酶體的融合，而是抑制了LC3-PE的去脂化過程，最終阻斷細胞自噬。這為進一步明確ATG4B在自噬信號通路中的調(diào)控作用提供了新的理論基礎(chǔ)。通過抗腫瘤作用的研究，發(fā)現(xiàn)S130可有效抑制結(jié)腸癌細胞的生長，且營養(yǎng)缺乏能進一步增強S130的抗腫瘤效果，而過表達ATG4B可部分對抗S130引起的腫瘤細胞死亡，提示ATG4B可能是腫瘤治療中的潛在靶點。同時，藥代動力學實驗結(jié)果表明，該抑制劑在體內(nèi)主要分布于腫瘤組織，從而抑制結(jié)腸癌細胞的生長。綜上，該研究表明ATG4B可能是腫瘤治療的潛在藥物靶標，而S130作為高效的ATG4B小分子抑制劑具有開發(fā)成為腫瘤治療藥物的潛能。

本發(fā)明涉及分子微生物學領(lǐng)域，具體的說是一種C型凝集素(C-type?lectin)及其制備和應(yīng)用。C型凝集素為序列表SEQ?ID?No.1中的氨基酸序列所示。制備方法：以許氏平鮋cDNA為模板PCR擴增C型凝集素基因，構(gòu)建質(zhì)粒pLecC；將pLecC轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21Transetta(DE3)，對轉(zhuǎn)化子進行誘導(dǎo)表達后，收集上清，濃縮后即得重組C型凝集素。所述C型凝集素對多種弧菌具高效凝集作用，經(jīng)C型凝集素處理后的細菌對許氏平鮋的侵染能力顯著降低。因此，該C型凝集素有望應(yīng)用于魚類細菌性病害的防治。

本項目是采用種子蛋白質(zhì)基因工程手段，將富含賴氨酸的豌豆球蛋白基因（Vicilingene）轉(zhuǎn)入超大穗小麥體內(nèi)并令其表達，以期大幅度提高超大穗小麥的種子蛋白質(zhì)含量和賴氨酸含量，改良超大穗小麥的營養(yǎng)品質(zhì)和加工品質(zhì)，使超大穗小麥盡快成為大面積推廣種植的超高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)小麥良種。其次，本項研究將豐富分子遺傳學理論并開辟一條高蛋白品質(zhì)育種的新途徑，所

Mpa六聚體除了與真核生物蛋白酶體調(diào)節(jié)顆粒Rpt1-Rpt6蛋白六聚體以及古細菌PAN蛋白六聚體具有一定的結(jié)構(gòu)同源性之外，還具有一些明顯不同的結(jié)構(gòu)特征：（1）結(jié)核桿菌Mpa具有形成雙環(huán)的兩個串聯(lián)寡核苷酸/寡糖結(jié)合（OB）結(jié)構(gòu)域，而古細菌蛋白酶體相關(guān)ATPase調(diào)控顆粒（PAN）和真核生物蛋白酶體ATPase調(diào)控顆粒復(fù)合體（Rpt1-6）每個蛋白亞基都只具有單個OB結(jié)構(gòu)域；（2）Mpa在具有蛋白酶體活化功能的C末端之前具有一個泛素樣的β-grasp結(jié)構(gòu)域，而古細菌PAN和真核生物Rpt1-6蛋白復(fù)合體并不具有這樣的一個β-grasp結(jié)構(gòu)域? 由于β-grasp結(jié)構(gòu)域的存在，Mpa六聚體中各個蛋白亞基C末端被埋在結(jié)構(gòu)核心中而沒有暴露在蛋白復(fù)合體結(jié)構(gòu)的表面，這就影響了C末端的GQYL基序與20S 蛋白酶體復(fù)合體的對接，從而阻礙了六聚化的Mpa與七次對稱的28聚體的蛋白酶體相互作用。我們通過功能研究進一步解釋了為什么單獨的Mpa六聚體在體外情況下不能有效結(jié)合蛋白酶體核心顆粒并啟動蛋白質(zhì)特異性降解，結(jié)合晶體結(jié)構(gòu)域功能研究，我們提出了結(jié)核桿菌蛋白酶體ATPase調(diào)控顆粒Mpa與20S蛋白酶體復(fù)合體這一分子量超過1100KDa蛋白質(zhì)機器的作用模型

1.痛點問題 自身免疫系統(tǒng)疾病是困擾人類的一大類疾病，醫(yī)學界對其中很多種疾病的具體發(fā)病原因還所知甚少。目前的治療手段和方法也極其有限，幾乎沒有任何真正的靶向藥物和能夠根治的療法，其治療難度和患者痛苦程度都不亞于癌癥。 IRAK4是固有免疫系統(tǒng)上IL-1家族和TLR家族這兩大信號通路交匯的最重要的節(jié)點。IRAK4和MyD88通過形成復(fù)合物來開啟下游各種與免疫反應(yīng)或細胞生長相關(guān)的基因表達。IRAK4與其他激酶不同，它既是下游信號分子的激酶，又同時起到形成復(fù)合物所必需的支架蛋白的作用。雖然，現(xiàn)有技術(shù)已有眾多IRAK4小分子激酶抑制劑，但它們僅可以抑制激酶本身的活性，顯示出中等的效力，無法破壞復(fù)合物的形成來徹底阻斷炎癥反應(yīng)信號的產(chǎn)生。而PROTAC技術(shù)可通過降解靶蛋白同時阻斷IRAK4激酶活性和破壞靶蛋白支架功能，相對于常規(guī)的激酶抑制劑產(chǎn)生更好的抑制炎癥反應(yīng)效果。 2.解決方案 本項成果涉及一類可以降解IRAK4蛋白的小分子降解劑，可以同時消除IRAK4蛋白的激酶功能和支架蛋白功能。相較于小分子抑制劑，該類小分子降解劑有更強的抑制炎癥反應(yīng)的效果。有望用于開發(fā)新型、高效、新機制的抗炎小分子藥物，同時拓展該類分子在癌癥治療中的作用。 PROTAC是一種具有雙功能的雜合小分子，通過合適的連接鏈將靶蛋白配體與E3泛素連接酶配體連接，促使目的蛋白（POI）與E3連接酶形成三元復(fù)合物，從而使靶蛋白接近泛素化系統(tǒng)，實現(xiàn)靶蛋白的泛素化，隨后被蛋白酶體的26S亞基識別，最終導(dǎo)致靶蛋白降解。 合作需求 項目合作開發(fā)、落地空間、研發(fā)團隊或第三方資金投入。

本發(fā)明涉及一種消除發(fā)酵豆粕中β?伴大豆球蛋白的方法。該方法包括如下步驟：(1)調(diào)節(jié)豆粕的含水量在20％～25％(重量比)；(2)用110℃～125℃的蒸汽處理步驟(1)得到的豆粕，出料、冷卻；(3)對步驟(2)得到的豆粕接種酵母菌和屎腸球菌，調(diào)節(jié)接種物料的含水量在38％～42％(重量比)；(4)對步驟(3)得到的豆粕進行厭氧發(fā)酵。本發(fā)明能夠顯著地降低

本發(fā)明成功將 EAMM 蛋白和抗原 HspX 在基因水平進行融合構(gòu) 建了新的融合蛋白 EAMMH，并將該不帶標簽的融合蛋白成功進行表 達和純化。EAMMH 融合蛋白以可溶形式表達，明顯改善了 EAMM 以包涵體進行表達的狀況。此外，EAMMH 蛋白融合了結(jié)核分枝桿菌 主要的生長期抗原和休眠期抗原，并可誘導(dǎo)較強的針對各期抗原的特 異性細胞免疫和體液免疫應(yīng)答。小鼠結(jié)核分枝桿菌氣霧攻擊模型證 明，該新的融合蛋白疫苗具

現(xiàn)有伴隨診斷主要是基因檢測，而基因突變并不等于蛋白質(zhì)表達，更不意味著靶點激活。本項目基于蛋白組學，特異性捕獲磷酸化酪氨酸激酶（最主要靶點），直接檢測靶點激活狀態(tài)，極低成本為腫瘤用藥提供最精準指導(dǎo)。