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蛋白酶體是細胞中用來調控特定蛋白質的濃度和清除錯誤折疊蛋白質的主要機制的核心組成部分，是細胞中最普遍的不可或缺的大型全酶超分子復合機器之一，也是迄今為止發現的最大的蛋白降解機器。人源蛋白酶體全酶包含至少64個亞基，由蓋子 (Lid)和基座(Base)亞復合體組成的調控顆粒RP(Regulatory Particle)所激活。2016年，該課題組與其合作者在《美國科學院院刊》報道了人源蛋白酶體的基態近原子分辨的冷凍電鏡結構，以及三個亞納米分辨的RP-CP亞復合體亞穩或過渡態的共存結構，并首次發現其中一個亞穩態構象的CP的底物轉運通道處于開放狀態（見PNAS 2016, 113: 12991-12996）。這一發現被德國馬普所Baumeister課題組及其合作者在2017年的一篇《美國科學院院刊》論文中通過酵母蛋白酶體全酶的冷凍電鏡亞納米精度分析進一步證實、引用和比較（見PNAS 2017, 114, 1305-1310）。然而，在這些工作中，CP開放態的全酶結構離近原子分辨還有較大距離，未能充分揭示人源蛋白酶體全酶的激活后的運動行為。毛有東、歐陽頎課題組及其合作者在前期工作的基礎上，利用他們自主開發的基于統計流行算法的高性能計算軟件ROME（見PLoS ONE 2017, 12:e0182130）與優化的冷凍電鏡處理方法，對ATP-γS結合狀態下的人源蛋白酶體的全酶冷凍電鏡單顆粒數據展開了深入分析，得到了6個共存的動態結構，其中包括3.6埃分辨率的基態結構，3.5埃的開放態CP結構，和三個CP開放態對應的亞穩簡并態全酶4.2埃，4.3埃和4.9埃的結構。另外兩個中間態結構分辨率為7.0埃和5.8埃。三個CP開放態對應的全酶結構的主要差別在于位于RP的AAA-ATPase激酶馬達模塊，伴隨其不同的構象變化，至少有四個ATP-γS分子穩定結合在不同的AAA-ATPase亞基上，為其在不同核酸結合狀態下形成的非穩定動態構象提供了重要證據。該研究首次觀察到位于AAA-ATPase激酶馬達模塊中心的底物轉運通道呈現從螺旋到鞍形不同的拓撲結構變化，為進一步分析底物和蛋白酶體全酶的相互作用奠定了重要基礎。人源蛋白酶體全酶AAA-ATPase馬達模塊中心的底物轉運通道發生大幅度的拓撲變構

近日，藥學院錢旭紅院士、楊泱泱副教授課題組在蛋白靶向降解策略研究中取得重要進展，相關成果以“An Endoplasmic Reticulum (ER)-Targeting DNA Nanodevice for Autophagy-Dependent Degradation of Proteins in Membrane-Bound Organelles”為題發表于著名期刊Angew. Chem. Int. Ed. (DOI: 10.1002/anie.202205509)，并入選VIP (Very Important Paper)。

miRNA是一類高度保守的內源性單鏈非編碼核苷酸片段，近年來，越來越多的研究發現miRNA的異常表達與疾病的發生和發展存在著直接或間接的關系，因此，實現活體內多種miRNA的定量檢測，對于疾病的早期診斷和監測具有重要意義。 我校食品學院匡華教授團隊博士生瞿愛華采用構筑了“核-衛星”樣納米結構，實現了細胞及活體內兩種腫瘤標志物miR-21和miR-200b的同時定量檢測，檢測限達到3.2 zmol/ngRNA和10.3 zmol/ngRNA。 基于核-衛星樣組裝結構的miR-21和miR-200b的同時檢測思路；（B）組裝結構在細胞內的隨時間熒光動態變化；（C）細胞內miR-21和miR-200b的同時定量測定。 研究人員利用DNA可控自組裝技術，構筑了金納米棒(GNR)與上轉換納米粒子（UCNP）的“核-衛星”樣組裝結構。其中，端面的UCNP修飾TAMRA熒光分子，能夠識別miR-21，側面的UCNP修飾TAMRA熒光分子，識別miR-200b。形成核-衛星狀組裝結構后，由于UCNP的發射光被猝滅，當遇到目標物miR-21或miR-200b時，UCNP從GNR表面解離，上轉換發光恢復，TAMRA和Cy5.5的熒光激發峰與UCNP的發射峰部分重疊，產生上轉換發光共振能量轉移，通過監測588nm和736nm處的熒光強度，可實現細胞內miR-21和miR-200b的同時定量檢測以及活體熒光成像。

銅離子是人體必需的微量元素，但其過量蓄積會導致疾病發生，如威爾森病。威爾森病是ATP7B基因突變導致的常染色體隱性遺傳病，ATP7B基因突變使其編碼的ATP7B蛋白功能受損，肝細胞膽管側的ATP7B無法轉運銅離子至膽汁以排泄，過量蓄積的銅離子經肝細胞血管測進入血液循環，引起全身多臟器損傷，其中肝臟和神經系統病變最常見。

近日，西湖大學鄭鉅圣、郭天南團隊聯合中山大學、劍橋大學等團隊首次在中國漢族人群中揭示了血液蛋白質組的遺傳機制。

SlRBP1通過與SleIF4A2翻譯起始復合物結合促進靶標RNAs翻譯以調節葉綠體功能。該發現闡明了RNA結合蛋白依托細胞器調控番茄生長發育的機制，為番茄增產、品種改良提供了潛在育種價值。