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新冠病毒與SARS存在交叉保護表位的研究
同濟大學曹志偉教授團隊與上海市公共衛(wèi)生臨床中心合作，關于武漢新型冠狀病毒2019-nCoV抗原性計算的文章（Identification of potential cross-protective epitope between 2019-nCoV and SARS virus），2020年1月30日在 Journal of Genetics and Genomics在線發(fā)表。 研究表明，S蛋白是冠狀病毒與宿主細胞表面ACE2受體結合、進而介導病毒入宿主細胞的關鍵表面蛋白，是疫苗抗體研發(fā)的重要靶點。基于具有自主知識產(chǎn)權的免疫原性計算工具CE-Blast，研究小組對所有冠狀病毒的S蛋白進行了系統(tǒng)性的結構模擬和免疫原性掃描，計算了新病毒與已知17種冠狀病毒亞型之間的免疫原性距離，發(fā)現(xiàn)新病毒S蛋白的免疫原性總體上與SARS更為接近。進一步計算揭示，2019武漢新冠狀病毒與SARS冠狀病毒的S抗原在受體接合區(qū)域（RBD）上存在潛在交叉反應表位。最為重要的是，其中一處與人ACE2受體結合位點緊密毗鄰。因此，針對該表位區(qū)域研發(fā)抗體，空間位阻效應可能阻斷病毒與ACE2受體的結合，有望起到病毒感染保護作用。同時，針對該表位區(qū)域的SARS抗體，可能對2019新病毒具有潛在臨床治療價值。
同濟大學
2021-04-10
15分鐘新冠病毒感染快檢產(chǎn)品
南京大學健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)國家研究院與南京大學校友企業(yè)江蘇美克醫(yī)學技術有限公司聯(lián)合研發(fā)出的15分鐘快速檢測新型冠狀病毒感染的IgM/IgG抗體檢測試劑盒(免疫層析法)，已在江蘇省各地市疾病預防控制中心投入使用。這款試劑盒經(jīng)過南京市第二醫(yī)院等單位的大樣本試用檢測，發(fā)現(xiàn)能夠快速、簡便、準確的篩查新型冠狀病毒感染患者，完全符合市場的迫切需求。 南京大學將首批免費向淮安市捐贈1萬人份的新型冠狀病毒（2019-nCoV）lgM/lgG抗體檢測試劑盒投入人群監(jiān)測。研發(fā)產(chǎn)品 由南京大學與美克醫(yī)學聯(lián)合研制成功的新型冠狀病毒（2019-nCoV）lgM/lgG抗體檢測試劑盒應用了免疫層析法。lgM/lgG抗體是從感染到發(fā)病中出現(xiàn)的人體抗體，是近期感染的標志。在感染過程中l(wèi)gM是人體免疫系統(tǒng)中首先出現(xiàn)的抗體，然后lgG抗體出現(xiàn)，伴隨著lgM抗體衰減。檢測急性感染期新型冠狀病毒（2019-nCoV）特異性lgM/lgG抗體具有敏感性高、診斷及時、能判定疑似者是否感染等優(yōu)點。因此，檢測新型冠狀病毒(2019-nCov)lgM抗體具有重要的臨床意義，對有效控制大規(guī)模傳播具有重要的意義。 新型冠狀病毒（2019-nCoV）lgM/lgG抗體檢測試劑盒目前已投入人群監(jiān)測中，在首批試用后，快速、簡便、有效、精準的病毒檢測效果得到北京疾病預防控制中心、江蘇省疾病預防控制中心和華中科技大學協(xié)和武漢紅十字會醫(yī)院等多省市疾控中心、省傳染病醫(yī)院、多家教學醫(yī)院20多家醫(yī)療機構的肯定，并積極響應加入新型冠狀病毒（2019-nCoV）lgM/lgG抗體檢測產(chǎn)品的驗證工作中。
南京大學
2021-04-10
新冠病毒IgM/IgG抗體聯(lián)合檢測試劑盒
南開大學生命科學學院丁丹教授團隊牽頭，聯(lián)合南方醫(yī)科大學南方醫(yī)院鄭磊教授團隊、華南理工大學唐本忠院士團隊、深圳金準生物醫(yī)學工程有限公司開展聯(lián)合攻關,成功研制出新冠病毒IgM/IgG抗體聯(lián)合檢測試劑盒，并已實現(xiàn)量產(chǎn)。 1例（63.9%），IgG陽性138例（87.3%），在151例健康對照及非新冠肺炎疾病中特異性為98.7%。
南開大學
2021-04-10
氣溫在新冠病毒傳播過程中的影響研究
2020年2月25日，中山大學的研究人員在預印本網(wǎng)站 medRxiv 上發(fā)布了一項研究成果，探討了氣溫在新型冠狀病毒（SARS-CoV-2）傳播過程中的作用，并提出，二者之間可能存在非線性劑量-反應關系，當達到某一溫度時，病毒傳播率最高，隨后溫度的上升或將抑制病毒的傳播。 研究人員收集了2020年1月20日至2月4日期間，我國34個省(包括直轄市、自治區(qū))和26個海外國家共計429個城市的確診病例數(shù)及每日氣溫，計算了1月份的平均氣溫、最低氣溫和最高氣溫的日平均值，并利用約束三次樣條函數(shù)和廣義線性混合模型分析了累計確診病例數(shù)與溫度之間的關系。模擬方程的計算結果顯示，當平均氣溫為8.72℃，最低溫度為6.70℃，最高溫度為12.42℃時，累計確診病例數(shù)達到峰值。此后，隨著溫度的上升，累計確診病例數(shù)將下降。 全球COVID-19傳輸?shù)淖罡邷囟扰c累計確診病例數(shù)（lgN）的三次樣條曲線根據(jù)以上溫度拐點，研究人員將429個城市分為低溫組和高溫組，并采用廣義線性回歸模型進一步分析溫度與累計病例數(shù)之間的關系。結果顯示，低溫組中，平均溫度、最低溫度和最高溫度每升高1℃，累積病例指數(shù)分別增加0.83、0.82和0.83。在高溫組中單因素模型中，最低溫度每升高1℃，累積病例指數(shù)就會減少0.86。而當溫度達到30℃時，累計病例指數(shù)將降至最低。這說明SARS-CoV-2對高溫敏感，溫度的提升能夠阻止病毒擴散。此前已有研究表明，SARS-CoV和MERS-CoV等冠狀病毒的傳播與溫度有關。在22-25℃，相對濕度為40-50%的環(huán)境中，SARS-CoV在光滑的表面上能保持至少5天的活性，而當溫度升高到38℃，相對濕度為95%時，病毒很快就會出現(xiàn)失去了活力。同樣，MERS-CoV在低溫、低濕度環(huán)境下，無論是作為固體表面上的液滴還是作為氣溶膠，都可以長期保持其活性。
中山大學
2021-04-10
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茶葉有效成分EGCG對防治新冠病毒的研究
該研究團隊利用創(chuàng)建的植物功效組學技術平臺研究發(fā)現(xiàn)，從茶中篩選到的有效單體分子EGCG（表沒食子兒茶素沒食子酸酯）能夠強力結合新冠病毒S蛋白（Kd=121nM），并有效阻斷新冠病毒S蛋白與人ACE2受體的結合。同時，研究過程發(fā)現(xiàn)，EGCG不僅能阻止兩者相互結合，并且對已經(jīng)結合受體的S蛋白還有促進二者解離的作用。目前，國內(nèi)外尚未找到與新冠病毒S蛋白親和力強、并且能夠有效阻斷S蛋白與ACE2結合的分子。這一發(fā)現(xiàn)為開發(fā)預防和治療新冠病毒感染的相關制劑提供了非常有價值的科學數(shù)據(jù)，同時為從食藥同源植物寶庫中應急篩選抗病毒成分并迅速用于臨床提供了一個創(chuàng)新的模式。云南農(nóng)大普洱茶學教育部重點實驗室與昆明生物制造研究院有限公司于2020年1月20日聯(lián)合組建了“抗新冠病毒攻關小組”。研究團隊根據(jù)發(fā)布的新冠病毒基因序列合成并表達了5個感染人類的冠狀病毒S蛋白，通過計算機模擬篩選方法對110余種藥食物同源植物中的800余種化合物進行了初步選擇，從中優(yōu)選出20余種化合物進行實驗驗證。通過分子互作實驗、分子水平阻斷實驗發(fā)現(xiàn)了與S蛋白具有親和力的5個天然化合物。
云南農(nóng)業(yè)大學
2021-04-10
一種新的錄組測序快速建庫方法
基于SHERRY方法的轉錄組測序建庫流程如圖1所示，樣本可以來自裂解的單細胞或bulk RNA；RNA分子經(jīng)過oligo-dT 引物的反轉錄后，RNA/DNA雜合鏈可直接被Tn5轉座酶打斷（圖中灰色的波浪線及直線分別代表RNA及DNA分子）；在Tagmentation之后，轉座酶會在雜合鏈兩端加上adaptor接頭，進行之后的建庫PCR擴增。 基于100pg的RNA起始量，SHERRY表現(xiàn)出了高的read匹配率，同時可檢測出近9000個基因，其中72%的基因可在三個重復樣本中檢測出，可重復性較好。與目前普遍應用于單細胞轉錄組測序的Smart-seq2技術相比，SHERRY與其建庫質量不相上下，并且具較低的GC bias。此外，SHERRY整個流程僅需要5個步驟，且可在一個管子中完成，整個時間僅約4小時，其中手工操作時間不到半小時。相比之下，Smart-seq2整個耗時約為SHERRY二倍的時間，且需要一些前處理等操作；此外，包含十個步驟的NEBNext方法則需要更加多的實驗室操作和時間成本。值得一提的是，在成本方面，SHERRY方法僅為其他兩種方法的五分之一，將大大節(jié)省實驗成本。
北京大學
2021-04-10
新冠肺炎疫情數(shù)據(jù)導航、防控態(tài)勢及溯源研究
為服務社會大眾了解疫情走勢，并為相關部門提供決策支持，北京航空航天大學北航大數(shù)據(jù)與腦機智能高精尖創(chuàng)新中心劉旭東教授、胡春明教授、李建欣教授等組織師生，與復雜系統(tǒng)可靠性實驗室李大慶研究員聯(lián)合組成團隊，全力投入建模和系統(tǒng)研發(fā)，已向決策部門提供疫情數(shù)據(jù)評估與預警報告、區(qū)域物資保障評估專項報告等，并迅速開發(fā)“新冠肺炎疫情數(shù)據(jù)導航服務”平臺，數(shù)據(jù)單日訪問量近 5 萬次。此外，中心還進行新型冠狀病毒的疫情評估與預測報告并開發(fā)疫情實時更新系統(tǒng)。中心對疫情現(xiàn)狀進行分析和預測，為公眾提供及時、準確的疫情態(tài)勢分析、走勢預測、輿情動態(tài)和政策措施等智能數(shù)據(jù)服務，實現(xiàn)全國及重點城市日度傳播系數(shù)計算、短期確診人數(shù)預測和長期疫情拐點與結束日期預測、疫情緩解系數(shù)評估等功能。此外，大數(shù)據(jù)與腦機智能高精尖創(chuàng)新中心研究團隊根據(jù)疫情確診患者相關公開數(shù)據(jù)，利用自然語言處理等技術，從已公開全國各省市直轄區(qū)四千余位確診患者軌跡中抽取了基本信息(性別、年齡、常住地、工作、接觸史等)、軌跡(時間、地點、交通工具、事件)及病患關系形成結構化信息。同時開發(fā)確診患者軌跡可視化查詢與分析系統(tǒng)，為疫情傳播與防控相關研究提供有效支撐。
北京航空航天大學
2021-04-10
用相關病毒模型篩選抗2019新冠病毒老藥
病毒的同源性包括基因組核苷酸序列的同源，也包括蛋白質氨基酸序列的同源。在序列比對方面，穿山甲冠狀病毒與新冠病毒在氨基酸序列同源性方面超過90%的相似度。對于藥物篩選來說，蛋白質氨基酸序列的同源性越高，意味著病毒生命活動的方式越相近，可以形象地理解為，兩個病毒的“行為方式”非常一致。這種“行為方式”與新冠病毒極為相似的病毒，能不能替代新冠病毒用于藥物篩選呢？童貽剛敏銳地意識到：如果可以，那么“篩藥”工作將在針對新冠病毒的同時，也保障了實驗的安全性，篩藥工作將走出高安全等級實驗室，走進普通P2實驗室。
北京化工大學
2021-04-10
15分鐘新冠病毒感染快檢產(chǎn)品
由南京大學與美克醫(yī)學聯(lián)合研制成功的新型冠狀病毒（2019-nCoV）lgM/lgG抗體檢測試劑盒應用了免疫層析法。lgM/lgG抗體是從感染到發(fā)病中出現(xiàn)的人體抗體，是近期感染的標志。在感染過程中l(wèi)gM是人體免疫系統(tǒng)中首先出現(xiàn)的抗體，然后lgG抗體出現(xiàn)，伴隨著lgM抗體衰減。檢測急性感染期新型冠狀病毒（2019-nCoV）特異性lgM/lgG抗體具有敏感性高、診斷及時、能判定疑似者是否感染等優(yōu)點。因此，檢測新型冠狀病毒(2019-nCov)lgM抗體具有重要的臨床意義，對有效控制大規(guī)模傳播具有重要的意義。
南京大學
2021-04-10
新冠肺炎病毒傳播在建筑中的影響和控制
關于新冠肺炎病毒傳播在建筑中的影響和控制建議”的研究分析，由東南大學建筑學院建筑技術與科學研究所副教授李永輝及其團隊完成。在當前疫情防控和部分企業(yè)復工在即的形勢下，對停留時間長、室內(nèi)人員密度大、感染風險高的住宅、辦公樓和醫(yī)院三類建筑使用中的疫情防控進行了研究分析。基于三種建筑類型的使用特點、室內(nèi)人員活動特征、空調系統(tǒng)的設計、設備運行的管理優(yōu)化措施等角度，對新型冠狀病毒傳播的預防與控制進行了研究分析并提出建議措施，助力疫情防控，并以期能夠對后續(xù)同類型建筑的規(guī)劃設計提供參考。該研究分別從以下方面進行研究分析并提供建議：1.住宅建筑?廚房排煙道；空調系統(tǒng)；電梯；樓梯間。2.辦公建筑辦公建筑內(nèi)空調系統(tǒng)的合理使用；全空氣空調系統(tǒng)及其使用策略；風機盤管加新風系統(tǒng)及其使用策略；多聯(lián)機及分體式空調與其使用策略；辦公建筑的應急管理措施建議；辦公人員的自我防護建議。3.醫(yī)院建筑醫(yī)院手術室；傳染病專用門診科室；專用隔離區(qū)域；普通科室及其他區(qū)域；基于新型肺炎疫情對醫(yī)院空調系統(tǒng)設計及運行管理方面的建議。新建醫(yī)院建筑空調系統(tǒng)設計建議，既有醫(yī)院建筑空調系統(tǒng)在疫情期間運行建議。
東南大學
2021-04-10