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南方科技大學
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以色譜中心策略算法(CCS)提高基于質譜的組學數據質量

2021-04-11 00:00:00
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所屬領域:
生物、醫藥及醫療機械
項目成果/簡介:

南科大醫學院教授張文勇、研究助理教授欒合密等在國際著名生物信息學與計算生物學期刊Bioinformatics上發表題為“CPVA: a web-based metabolomic tool for chromatographic peak visualization and annotation”的論文。該研究創新提出了以色譜中心策略算法(CCS)提高基于質譜的組學數據質量,并搭建了R-Shiny的Web應用CPVA,實現了組學數據在線交互式的處理。



該論文提出了色譜中心策略算法(CCS),并開發了在線互動工具來解決該領域普遍存在的問題。色譜中心策略是指通過對組學數據中提取的色譜峰形狀進行數字化描述,包括對稱性(Symmetry)、鋸齒度(Jaggedness)、形態(Modality)、色譜質量指數(MCQ)等,并以在線互動的方式直接展示色譜峰的形態特征。

項目階段:
未應用
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